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SMMC7721:苏州鉴达细胞株鉴定预警系列1日期:2020-03-06

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导读

细胞株交叉污染、错误辨识是长期困扰生物医药基础研究的主要问题之一。近年来,学术界开始高度重视该问题。许多主流杂志也强制要求作者投稿时提供细胞株STR鉴定报告。但是,很多实验室仍存在误用问题细胞株的情况,其中肝癌、胃癌、鼻咽癌细胞株误用最为严重。

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(图片来源ICLAC Database

● 鉴达将推出细胞株污染预警系列,以帮助大家减少使用交叉污染、错误辨识细胞株的使用,保证文章数据的可靠性、真实性。



此篇为大家讲解的是肝癌细胞株SMMC-7721


来源

最初的SMMC-7721是由我国第二军医大学病理解剖学教研室于1977年建立,细胞株从第二军医大学附属医院肝外科的一名50岁男性肝癌患者获取、建立。在其使用初期,相关的甲胎蛋白免疫荧光反应、乳酸脱氢酶(LDH)同功酶的检测显示,SMMC-7721符合肝癌细胞的特性,它的建立对当时国内肝癌防治的实验研究和基础理论研究提供了一个较好的细胞实验模型。


HELA污染

由于国内建株,国外实验室对SMMC-7721使用率不高,SCI期刊编辑部审稿人对此细胞株也不熟悉。2010年之前,国内作者投稿SCI时,编辑部对肝癌细胞株SMMC-7721的身份认证要求相对宽松,有些杂志审稿人要求说明SMMC-7721的来源即可,有些杂志审稿人则没有这方面要求;从2010Int J Cancer杂志开始建议作者投稿时需提供细胞株STR鉴定报告起,细胞株STR鉴定开始受到各方重视,主流期刊均陆续要求投稿需提供所用细胞株遗传背景。SMMC-7721HeLa污染的问题才被揭示

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(图片来源:ExPASy Database

2015Fang Ye等人在FASEB J.上发表文章,文章根据380株细胞株的STR分型结果,报道了国内细胞株交叉污染状况。380个样本中有两株SMMC-7721分别来源于不同的实验室),一株被非人源细胞细胞污染,未扩增成功;另一株的分型数据则提示,细胞株是HeLa来源。2017年又有三篇相关文章(PMID分别是:281074332885194228807831)发表,进一步验证了SMMC-7721HELA污染。据此,ExPASy数据库对SMMC-7721的信息作出明确提示:"Problematic cell line: Contaminated. Shown to be a HeLa derivative.";而在ICLACThe Register of Misidentified Cell Lines中,SMMC-7721也被收录其中(ICLAC-00554)

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(图片来源:Fang Ye et al., 2015


鉴达的SMMC-7721鉴定

截止目前,鉴达受理SMMC-7721共计27株。与ExPASyDSMZ数据库重新比对确认后,实际鉴定结果显示:有21株为HeLa来源,5株为无匹配结果,1株为SiHa细胞。HeLa来源的21株的结果中,11株为HeLa S35株为HeLa4株为HeLa [Chang Liver]1株为HeLa 229鉴达所受理的SMMC-7721鉴定结果,同样验证了SMMC-7721HeLa污染的事实。

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(图片来源:鉴达所受理SMMC-7721鉴定结果)


结合文献报道、各数据库信息及鉴达鉴定结果,对于专注肝癌方面基础研究的实验室,鉴达不推荐使用SMMC-7721来开展相关实验!可使用HepG2HuH7SK-HEP-1Hep3B肝癌细胞株,购买渠道最好选择权威单位。鉴达建议,不管从任何单位购买,细胞株都应第一时间进行STR鉴定,以确认其身份。



参考文献:

1.董荣春等,SMMC-7721人体肝癌细胞株的建立及其生物学特性的初步观察,第二军医大学学报01(003):5~9,1980

2. Fang Ye et al., Genetic profiling reveals an alarming rate of cross-contamination among human cell lines used in China. FASEB J. 2015 Oct;29(10):4268-72.

3. Huang Y et al., Investigation of Cross-Contamination and Misidentification of 278 Widely Used Tumor Cell Lines. PLoS One. 2017 Jan 20;12(1):e0170384.

4. Bian X et al., A Combination of Species Identification and STR Profiling Identifies Cross-contaminated Cells from 482 Human Tumor Cell Lines. Sci Rep. 2017 Aug 29;7(1):9774.

5. Rebouissou S et al., Note of caution: Contaminations of hepatocellular cell lines. J Hepatol. 2017 Nov;67(5):896-897.


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苏州鉴达采用STR分型技术,针对人源细胞20个位点进行检测,3500型、3130XL型遗传分析仪进行毛细管电泳,与DSMZCellosaurusATCC等数据库进行比对,出具权威英文报告,为全国近200家科研机构(高校、研究所、医院、公司)提供高质量服务,多家单位已利用鉴达细胞株鉴定服务在高水平期刊(如Clinical Cancer ResearchInt J CancerNature Commnications等)发表论文。

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