近日,苏州鉴达正式推出针对非人源检材的种属鉴定服务!
所谓种属鉴定,就是基于形态学、血清学或DNA分析等方法甄别种属特征、种属特异性成分或种属特异性DNA序列等,实现对非人源检材进行种属分类地位的认定。苏州鉴达便是采用DNA分析方法--DNA条形码技术(DNA Barcoding)对非人源检材进行种属鉴定。
DNA条形码
DNA条形码的概念最早是由加拿大的Dr.Paul Hebert在2003年提出的。DNA条形码是利用标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段在物种种内的特异性和种间的多样性而创建的一种生物身份识别系统,简单来说就是利用一个或多个特定基因的一小段DNA序列进行种属鉴定的方法。
基于DNA条形码技术的种属鉴定具体实验流程如下图所示,实验步骤共分5步。
而引物的选择与应用是实验流程的关键步骤,这是因为DNA条形码的特定基因并不唯一。对于动物检材,目标区域所在基因一般为COI基因(线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ基因,cytochrome c oxidase I),16S rRNA基因和12S rRNA基因也可以作为DNA条形码的特定基因进行种属鉴定。另外,目标区域的引物可以自己进行设计也可以参考文献中的引物序列。苏州鉴达的种属鉴定(动物检材)引物选择的是16S rRNA基因的通用引物。
应用DNA条形码技术进行种属鉴定的优点如下:
(1)以DNA序列为检测对象,与传统方法相比,样本部分受损也不会影响鉴定结果。
(2)准确性高,特定的种属具有特定的DNA序列信息,而形态学鉴别特征会因趋同和变异导致种属鉴定产生误差。
(3)通过建立DNA条形码数据库(如NCBI数据库或BOLD网站),能够一次性快速鉴定大量样本,同时扩大了种属鉴定的范围。
案例分享
未知种属的非人源细胞系A进行种属鉴定:
对送检样本的16S rRNA基因的目标区域进行PCR扩增,PCR产物进行Sanger测序,测序结果与NCBI数据库中序列进行比对和分析,确定送检样本的种属。
参考文献:
1.www.jsdna.org/cell
2.http://www.jsdna.org/mobile/information/xuz
3.SF/T 0136-2023《法医学非人源生物检材种属鉴定技术规范》
苏州鉴达(Genetic Testing Biotechnology, GTB)采用STR分型技术,针对人源细胞23个基因座、小鼠源细胞19个基因座(18个小鼠源基因座+1个人源基因座TH01)进行检测,3130XL型遗传分析仪进行毛细管电泳,与DSMZ、Cellosaurus、ATCC等数据库进行比对,出具权威英文报告,为全国近550家科研机构(高校、研究所、医院、公司)提供高质量服务,多家单位已利用鉴达细胞株鉴定服务在高水平期刊(如Clinical Cancer Research、Nature Commnications、Int J Cancer等)发表论文。如需了解更多鉴达生物(Genetic Testing Biotechnology, GTB)相关细胞株鉴定信息,可扫码关注官方公众号。将本文转发至朋友圈(至少保留三天)。添加微信或QQ客服后,将朋友圈截图发给微信或QQ客服,并备注单位及课题组(示例:XX大学XX课题组)。后期可有两次机会享七五折优惠,原价1200元/株。微信:18112556907、QQ:2791427499
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